Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1812286	1812286	1	42 [0]	[0] 15	csrA	pleiotropic regulatory protein for carbon source metabolism

CAACTCGACGAGTCAGAATCAGCATTCTTTGCTCCTTGAAAGATTAAAAGAGTCGGGTCT  >  minE/1812287‑1812346 |                                                            cAACTCGACGAGTCAGAATCAGCCTTCTTTGCTCCTTGAAAGATTAAAAGAGTCGGGtct  <  1:2060884/60‑1 (MQ=255) cAACTCGACGAGTCAGAATCAGCATTCTTTGCTCCTTGAAAGATTAAAAGAGTCGGGtct  <  1:1025539/60‑1 (MQ=255) cAACTCGACGAGTCAGAATCAGCATTCTTTGCTCCTTGAAAGATTAAAAGAGTCGGGtct  <  1:1295703/60‑1 (MQ=255) cAACTCGACGAGTCAGAATCAGCATTCTTTGCTCCTTGAAAGATTAAAAGAGTCGGGtct  <  1:1659310/60‑1 (MQ=255) cAACTCGACGAGTCAGAATCAGCATTCTTTGCTCCTTGAAAGATTAAAAGAGTCGGGtct  <  1:193983/60‑1 (MQ=255) cAACTCGACGAGTCAGAATCAGCATTCTTTGCTCCTTGAAAGATTAAAAGAGTCGGGtct  <  1:2124730/60‑1 (MQ=255) cAACTCGACGAGTCAGAATCAGCATTCTTTGCTCCTTGAAAGATTAAAAGAGTCGGGtct  <  1:2289379/60‑1 (MQ=255) cAACTCGACGAGTCAGAATCAGCATTCTTTGCTCCTTGAAAGATTAAAAGAGTCGGGtct  <  1:2454948/60‑1 (MQ=255) cAACTCGACGAGTCAGAATCAGCATTCTTTGCTCCTTGAAAGATTAAAAGAGTCGGGtct  <  1:2816293/60‑1 (MQ=255) cAACTCGACGAGTCAGAATCAGCATTCTTTGCTCCTTGAAAGATTAAAAGAGTCGGGtct  <  1:3226289/60‑1 (MQ=255) cAACTCGACGAGTCAGAATCAGCATTCTTTGCTCCTTGAAAGATTAAAAGAGTCGGGtct  <  1:3356983/60‑1 (MQ=255) cAACTCGACGAGTCAGAATCAGCATTCTTTGCTCCTTGAAAGATTAAAAGAGTCGGGtct  <  1:3600964/60‑1 (MQ=255) cAACTCGACGAGTCAGAATCAGCATTCTTTGCTCCTTGAAAGATTAAAAGAGTCGGGtct  <  1:582321/60‑1 (MQ=255) cAACTCGACGAGTCAGAATCAGCATTCTTTGCTCCTTGAAAGATTAAAAGAGTCGGGtct  <  1:837593/60‑1 (MQ=255) cAACTCGACGAGGCAGAATCAGCATTCTTTGCTCCTTGAAAGATTAAAAGAGTCGGGtct  <  1:1717051/60‑1 (MQ=255) |                                                            CAACTCGACGAGTCAGAATCAGCATTCTTTGCTCCTTGAAAGATTAAAAGAGTCGGGTCT  >  minE/1812287‑1812346

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑