Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	minE	1,252,733	C→A	S569I (AGC→ATC)	aspS ←	aspartyl‑tRNA synthetase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	1,252,733	0	C	A	100.0%	121.6 / NA	36	S569I (AGC→ATC)	aspS	aspartyl‑tRNA synthetase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base A (0/36);  total (0/36)

AAAGCTCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACG  >  minE/1252729‑1252789     |                                                         aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:464157/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:1055430/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:3202019/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:3394843/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:3463511/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:3513421/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:382197/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:390102/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:437198/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:3121139/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:546887/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:859983/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:897467/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:90386/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:923475/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:927210/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:928834/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:942728/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:217232/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:1086674/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:1427804/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:1600021/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:1860683/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:2006388/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:2086190/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:2940812/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:2212802/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:2269552/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:2363152/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:2402183/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:2580833/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:2596566/61‑1 (MQ=255) aaaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:2770552/61‑1 (MQ=255)  aaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:1726688/60‑1 (MQ=255)  aaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:1452172/60‑1 (MQ=255)  aaGATCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACg  <  1:3203264/60‑1 (MQ=255)     |                                                         AAAGCTCGGTGCTTCAGTCATCAGACACGCTGCCGCCGTGGTTTTCGGGAAGGCGATAACG  >  minE/1252729‑1252789

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑