Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	minE	1,663,105	G→T	A32S (GCG→TCG)	yfgI →	conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	1,663,105	0	G	T	100.0%	333.8 / NA	94	A32S (GCG→TCG)	yfgI	conserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base T (94/0);  total (94/0)

CTCTCTGCTGTCGCAGAAGCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGA  >  minE/1663087‑1663148                   |                                            ctctctGCTGTCGCAGGATCGGGACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:343780/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTTAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1408241/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATg                        >  1:3202160/1‑40 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGc                  >  1:942488/1‑46 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACg   >  1:2918654/1‑61 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACg   >  1:1599439/1‑61 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:3072000/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2818349/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:342974/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:3315005/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:3267687/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:3250575/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2814588/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:315371/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:3150555/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:3123765/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:3082823/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2888770/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:3034506/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:3020021/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2987182/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2950789/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2859024/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2932336/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2913677/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2891583/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:524627/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:842983/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:817385/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:670585/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:652667/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:62835/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:617468/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:599061/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:579504/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:569821/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:524799/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:3444891/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:515394/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:481929/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:378070/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:3586936/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:3579743/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:3563947/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:3547523/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:3492179/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:347350/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1621360/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1118994/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1907137/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1847242/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1846763/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1786255/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1766915/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1766585/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1758302/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1753878/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1711871/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1627994/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1912001/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1617313/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1476283/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1448596/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1392024/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1389868/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:133860/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1317544/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1147064/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1136231/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1127305/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2372150/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2812805/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:277721/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2774413/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2768801/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2699283/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2556774/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2506184/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2494543/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2422103/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1922827/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2354658/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2333412/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:216766/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2145314/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2042092/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2026699/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2001665/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1988522/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:1960058/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGAATGACGa  >  1:1388080/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGAAGAATGACGa  >  1:3352791/1‑62 (MQ=255) ctctctGCTGTCGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAAAGAAGAGCAAAGGCAGCAAGACg   >  1:365423/1‑61 (MQ=255) ctctctGCTGTAGCAGGATCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGa  >  1:2634202/1‑62 (MQ=255)                   |                                            CTCTCTGCTGTCGCAGAAGCGGAACAGCAAGGTAAAAATGAAGAGCAAAGGCAGCATGACGA  >  minE/1663087‑1663148

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑