BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	minE	197,574	G→A	S9S (TCC→TCT)	proS ←	prolyl‑tRNA synthetase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	197,574	0	G	A	100.0%	424.5 / NA	123	S9S (TCC→TCT)	proS	prolyl‑tRNA synthetase
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (58/65); total (58/65)

Only 100 of 123 total aligned reads displayed.

GCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTGGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTA > minE/197548‑197626

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gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:551084/1‑62 (MQ=255)

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gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:2334187/1‑62 (MQ=255)

gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:2344098/1‑62 (MQ=255)

gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:2388193/1‑62 (MQ=255)

gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:412478/1‑62 (MQ=255)

gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:2470819/1‑62 (MQ=255)

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gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:304341/1‑62 (MQ=255)

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gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:2738889/1‑62 (MQ=255)

gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:2785694/1‑62 (MQ=255)

gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:3566946/1‑62 (MQ=255)

gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:2810729/1‑62 (MQ=255)

gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:3020336/1‑62 (MQ=255)

gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:3526558/1‑62 (MQ=255)

gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:3476486/1‑62 (MQ=255)

gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:2901051/1‑62 (MQ=255)

gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:686524/1‑62 (MQ=255)

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gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:930874/1‑62 (MQ=255)

gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:924264/1‑62 (MQ=255)

gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:1350398/1‑62 (MQ=255)

gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:89628/1‑62 (MQ=255)

gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:1367474/1‑62 (MQ=255)

gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:1391118/1‑62 (MQ=255)

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gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:672368/1‑62 (MQ=255)

gCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:1054050/1‑62 (MQ=255)

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gCGTCGGAAGGTGTCTCCTTGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACg                   >  1:1221137/1‑62 (MQ=255)

                   tGAGAGTATAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:870744/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGATCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:231738/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACTGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:1715974/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:3412563/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:3406018/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:988356/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:3341531/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:3432870/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:3548747/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:402786/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:417413/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:423124/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:561499/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:573318/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:685620/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:943112/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:945892/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:98808/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:200432/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:107632/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:1079668/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:1185302/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:1196924/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:1279862/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:1350823/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:1460213/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:1487825/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:1490472/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:1552000/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:1632768/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:1634458/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:1807942/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:1935332/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:3324388/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:2043627/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:2097797/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:2247089/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:2272661/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:2457939/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:2507307/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:2611335/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:2802798/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:2819010/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:289149/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:2898519/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:2920886/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:3173713/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:3240196/60‑1 (MQ=255)

                   tGAGAGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:3255340/60‑1 (MQ=255)

                    gagaGTAGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTa  <  1:1157830/59‑1 (MQ=255)

GCGTCGGCAGGTGTCTCCTTGAGAGTGGAGAGCAGGTATTGGCTAGTACGCATGTTGTTACGGTTCCAGTTGGAAGGTA > minE/197548‑197626

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 27 ≤` `ATCG/ATCG` `< 36 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`