Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2003434	2003564	131	34 [0]	[0] 68	[hybE]–[hybD]	[hybE],[hybD]

CTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGA  >  minE/2003372‑2003433                                                              | cTCAGCATCCACGGGGTGATCACCCACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:1135298/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGATCAGCGTAAAATCAGa  >  1:988728/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:350218/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:332330/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:355039/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:478124/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:513061/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:555438/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:624588/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:645309/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:715432/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:729390/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:762282/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:808873/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:83973/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:853073/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:89155/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:892044/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:1036106/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:328880/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:301885/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:205160/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:163337/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:14802/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:133280/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:1184300/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:114151/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:1140217/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:1120309/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:1096423/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:1061593/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:1059543/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:1041285/1‑62 (MQ=255) cTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACACCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGa  >  1:1131336/1‑62 (MQ=255)                                                              | CTCAGCATCCACGGGGTGATCACACACCCCGTCCACTGACCTTCGAACAGCGTAAAATCAGA  >  minE/2003372‑2003433

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑