Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2009498	2009504	7	35 [0]	[0] 38	yghW/yghX	hypothetical protein/ECK2993:JW5926:b2999; predicted hydrolase

GCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAT  >  minE/2009436‑2009497                                                              | gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:60842/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:1122668/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:395827/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:416322/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:47340/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:511677/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:550958/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:577961/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:585658/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:369680/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:635952/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:650196/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:656343/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:78585/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:794349/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:872566/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:908331/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:216279/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:1144092/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:1179451/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:1193410/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:121389/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:136201/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:180972/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:185137/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:200589/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:326560/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:226364/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:26336/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:300147/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:302234/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:316032/62‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:321963/62‑1 (MQ=255)  cACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAt  <  1:573381/61‑1 (MQ=255)                gTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTTTTCAt  <  1:418643/47‑1 (MQ=255)                                                              | GCACTGTCGGCATGCGTTGCTTTTAATCCCGCCATTAAGCCTTTACCAAAATGGTTATTCAT  >  minE/2009436‑2009497

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑