Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2040976 2041052 77 58 [0] [0] 75 yqiH/yqiI predicted periplasmic pilin chaperone/conserved hypothetical protein

AACGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGC  >  minE/2040914‑2040975
                                                             |
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:72230/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:102121/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:478123/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:487201/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:513272/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:537397/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:538911/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:559845/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:618328/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:619647/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:644708/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:66851/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:69214/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:698261/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:406873/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:728473/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:753914/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:763522/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:768256/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:778384/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:790613/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:818214/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:820057/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:861602/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:909367/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:920361/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:937009/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:99703/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:215425/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:107141/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:1169845/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:1173285/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:1174261/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:1190742/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:1192086/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:132550/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:14468/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:148797/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:196677/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:20945/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:401171/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:397425/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:26659/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:279821/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:298704/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:318888/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:358573/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:366857/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:36887/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:373915/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAACGTGATGc  <  1:241032/62‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAACGTGATGc  <  1:1150253/62‑1 (MQ=255)
 aCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:220539/61‑1 (MQ=255)
 aCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:1166222/61‑1 (MQ=255)
 aCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:633971/61‑1 (MQ=255)
  cGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:648335/60‑1 (MQ=255)
            ttttAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:349457/50‑1 (MQ=255)
                         gaAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:1126816/37‑1 (MQ=255)
                                                             |
AACGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGC  >  minE/2040914‑2040975

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: