Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2044750	2045075	326	22 [0]	[0] 38	yqiK	conserved hypothetical protein

CTGCCGAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAACC  >  minE/2044688‑2044749                                                              | cTGCCTAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAAcc  <  1:604271/62‑1 (MQ=255) cTGCCGAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAAcc  <  1:1081570/62‑1 (MQ=255) cTGCCGAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAAcc  <  1:860059/62‑1 (MQ=255) cTGCCGAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAAcc  <  1:82194/62‑1 (MQ=255) cTGCCGAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAAcc  <  1:798179/62‑1 (MQ=255) cTGCCGAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAAcc  <  1:792653/62‑1 (MQ=255) cTGCCGAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAAcc  <  1:773190/62‑1 (MQ=255) cTGCCGAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAAcc  <  1:736099/62‑1 (MQ=255) cTGCCGAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAAcc  <  1:722828/62‑1 (MQ=255) cTGCCGAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAAcc  <  1:660968/62‑1 (MQ=255) cTGCCGAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAAcc  <  1:627137/62‑1 (MQ=255) cTGCCGAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAAcc  <  1:593375/62‑1 (MQ=255) cTGCCGAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAAcc  <  1:470598/62‑1 (MQ=255) cTGCCGAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAAcc  <  1:438986/62‑1 (MQ=255) cTGCCGAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAAcc  <  1:112057/62‑1 (MQ=255) cTGCCGAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAAcc  <  1:1096641/62‑1 (MQ=255) cTGCCGAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAAcc  <  1:1007979/62‑1 (MQ=255)  tGCCGAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAAcc  <  1:34089/61‑1 (MQ=255)  tGCCGAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAAcc  <  1:1121050/61‑1 (MQ=255)  tGCCGAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAAcc  <  1:1099485/61‑1 (MQ=255)  tGCCGAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAAcc  <  1:925786/61‑1 (MQ=255)               cGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAAcc  <  1:338304/48‑1 (MQ=255)                                                              | CTGCCGAAGCCGATCGTGCTAAACAAGTTGCCCTAATCGCTGCCGCGCAGGATGCAGAAACC  >  minE/2044688‑2044749

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑