Missing coverage evidence...
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GATGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAG  >  minE/2099821‑2099882                                                              | gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGGCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:846426/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:1065780/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:993118/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:986935/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:955019/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:952594/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:939738/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:840456/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:831820/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:814585/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:751747/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:714888/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:681063/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:675173/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:616085/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:1038593/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:1085608/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:1163966/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:1168661/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:131568/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:146137/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:302665/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:398460/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:449296/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:653267/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCCCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:714138/62‑1 (MQ=255) gaTGTAACCCATCGAAACCCCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:712790/62‑1 (MQ=255)  aTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:1124704/61‑1 (MQ=255)  aTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:527467/61‑1 (MQ=255)  aTGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:99453/61‑1 (MQ=255)   tGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:894370/60‑1 (MQ=255)                        ttAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAg  <  1:459164/39‑1 (MQ=255)                                                              | GATGTAACCCATCGAAACCGCACTTAACTGCAACTCTTTTGCCACTTCGGTACCAGCAATAG  >  minE/2099821‑2099882

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑