Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2103266	2103320	55	41 [0]	[0] 12	agaR	DNA‑binding transcriptional dual regulator

CAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCG  >  minE/2103204‑2103265                                                              | cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:677782/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:391715/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:456647/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:466132/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:495706/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:574343/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:596407/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:597710/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:658065/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:660990/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:66506/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:357436/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:71643/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:73804/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:738921/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:806427/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:826846/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:847737/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:954292/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:965045/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:993203/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:1180791/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:1006556/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:1014651/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:1031391/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:1070257/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:1080323/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:1110688/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:1142283/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:1173888/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:1180761/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:1001562/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:170343/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:226119/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:227062/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:237874/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:243880/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:293997/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:30437/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:322983/1‑62 (MQ=255) cAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCg  >  1:331979/1‑62 (MQ=255)                                                              | CAGCATATCGAAGTGGTAATTTTGCAGCGATTGCTCAGCCTGATCGCCGTAAAAAGATTGCG  >  minE/2103204‑2103265

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑