Missing coverage evidence...
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ATGATCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGA  >  minE/2108533‑2108594                                                              | atgttCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:785270/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:1155782/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:919391/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:844908/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:708675/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:697338/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:67367/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:669404/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:649921/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:640642/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:621643/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:618607/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:617929/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:539712/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:421615/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:384158/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:376054/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:347904/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:343487/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:309728/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:266376/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:257146/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:217107/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:177764/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:135852/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:1184805/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:1175711/62‑1 (MQ=255) atgatCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:1093136/62‑1 (MQ=255)                cACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:538719/47‑1 (MQ=255)                          ttGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGa  <  1:872754/37‑1 (MQ=255)                                                              | ATGATCGACGGCAGCCACTTCCCGTTTGCCGAGAACGTGAAGCTGGTGAAATCGGTTGTTGA  >  minE/2108533‑2108594

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑