Missing coverage evidence...
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CTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAACCACACCACA  >  minE/2130424‑2130485                                                              | cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGCCGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:1137560/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccataccaca  >  1:233332/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:671860/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:504462/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:515415/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:540024/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:543632/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:571876/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:574943/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:5883/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:607586/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:620214/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:646631/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:494259/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:683716/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:722677/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:73563/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:740908/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:837210/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:876219/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:905393/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:922040/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:954912/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:955217/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:185844/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:1023726/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:1051469/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:1070754/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:1077345/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:111038/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:1115685/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:1138274/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:168732/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:170596/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:178592/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:500992/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:20647/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:217857/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:218611/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:316539/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:35593/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:385473/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:390313/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:39666/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacaccaca  >  1:1010584/1‑62 (MQ=255) cTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAAccacacaaca  >  1:284385/1‑62 (MQ=255)                                                              | CTTTCGCCCCCAGCACAATCGCTGTCATGCGACTGACGGCTTTAGTGCTCAACCACACCACA  >  minE/2130424‑2130485

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑