Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2133714	2133721	8	25 [0]	[0] 3	nlpI	conserved hypothetical protein

TCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAT  >  minE/2133653‑2133713                                                             | tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:562312/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:998292/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:941892/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:939064/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:92728/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:857022/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:747216/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:708398/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:68083/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:623789/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:608506/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:586797/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:103633/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:516002/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:497085/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:483203/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:461628/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:447232/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:366432/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:153519/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:1177101/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:1065033/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:1053469/1‑61 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAAAATATGCCTAAGTAAt  >  1:882110/1‑61 (MQ=255) tCAAACGATTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAt  >  1:1058365/1‑61 (MQ=255)                                                             | TCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAAT  >  minE/2133653‑2133713

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑