Missing coverage evidence...
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CCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATCAC  >  minE/2148116‑2148176                                                             | ccAGCACCTGCGAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:49258/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:700376/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:504512/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:507746/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:52737/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:545283/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:57572/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:581204/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:630268/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:658694/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:470897/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:76586/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:780162/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:794950/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:807891/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:889933/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:934835/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:948849/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:996655/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:2134/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:1134580/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:1139764/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:1146101/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:1150101/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:131758/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:133024/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:143634/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:183415/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:20601/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:1120623/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:280412/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:289871/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:349377/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:350802/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:376794/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:379787/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:448033/1‑61 (MQ=255) ccAGCACCTGCAAGCAAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac  >  1:323975/1‑61 (MQ=255)                                                             | CCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATCAC  >  minE/2148116‑2148176

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑