Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2170866	2170958	93	27 [0]	[0] 2	rpoN	RNA polymerase, sigma 54 (sigma N) factor

GTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAA  >  minE/2170804‑2170865                                                              | gTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:416781/62‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:977360/62‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:901458/62‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:866170/62‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:768050/62‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:762290/62‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:705057/62‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:668258/62‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:1014399/62‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:454084/62‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:39708/62‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:306544/62‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:161419/62‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:991764/62‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:1202076/62‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:115535/62‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:1136817/62‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:1098423/62‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:1096767/62‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:1076650/62‑1 (MQ=255) gTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGAAGCaa  <  1:990543/62‑1 (MQ=255)  tCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:879616/61‑1 (MQ=255)   cTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:590617/60‑1 (MQ=255)     ggAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:999080/58‑1 (MQ=255)      gAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:656714/57‑1 (MQ=255)                aCGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:989344/47‑1 (MQ=255)                    tACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCaa  <  1:137130/43‑1 (MQ=255)                                                              | GTCTGGAAAGCCGTAACGATACGCTACTGCGCGTGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAA  >  minE/2170804‑2170865

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑