Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2192372 2192727 356 68 [0] [0] 2 [sspA] [sspA]

TTGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCGTGT  >  minE/2192310‑2192371
                                                             |
ttGCTTACGTGCTGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:1136315/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:493714/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:556209/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:550093/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:543897/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:542115/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:535801/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:509353/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:504053/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:600446/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:492359/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:478332/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:416184/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:409773/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:393197/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:38977/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:1002304/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:592518/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:383916/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:602517/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:635603/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:691415/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:711822/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:742147/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:755126/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:757273/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:773108/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:773759/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:825021/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:866966/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:889701/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:958335/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:970820/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:133620/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:1007375/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:1012324/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:101370/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:1013889/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:1030685/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:1031406/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:104774/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:1061747/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:1094158/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:109729/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:1130689/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:1139747/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:1160470/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:1176845/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:126450/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:164591/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:171164/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:213926/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:233747/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:355605/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:241752/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:327808/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:248238/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:256278/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:280301/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:286048/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:288159/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:323521/62‑1 (MQ=255)
ttGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATAAGCgtgt  <  1:383176/62‑1 (MQ=255)
 tGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:86507/61‑1 (MQ=255)
 tGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:392829/61‑1 (MQ=255)
 tGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:521322/61‑1 (MQ=255)
 tGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:374898/61‑1 (MQ=255)
                  tGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCgtgt  <  1:1101556/44‑1 (MQ=255)
                                                             |
TTGCTTACGTGCGGCATCTGCTTCAGAAGCTGAACCGTTGATGATGGTGTTCATCAGCGTGT  >  minE/2192310‑2192371

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: