Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2204590	2204655	66	59 [0]	[0] 3	[aaeX]	[aaeX]

AGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGCCC  >  minE/2204555‑2204589                                   | aGCGATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:520437/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:768827/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:538103/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:542461/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:601902/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:60964/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:6111/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:611530/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:63861/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:639133/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:652645/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:677576/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:744120/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:76189/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:767376/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:524155/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:79778/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:820680/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:83025/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:839566/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:860365/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:866695/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:881645/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:888367/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:889078/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:892694/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:903018/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:935667/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:957811/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:979128/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:221046/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:1047356/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:1047456/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:106992/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:1104829/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:1114129/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:1124577/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:1133203/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:1136803/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:1166675/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:1193636/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:141957/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:171328/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:216259/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:535056/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:222834/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:238908/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:249107/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:339664/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:340323/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:352473/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:355354/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:396978/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:451776/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:479979/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:482166/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:500502/35‑1 (MQ=255) aGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:1031760/35‑1 (MQ=255) aGCAACTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGccc  <  1:1091094/35‑1 (MQ=255)                                   | AGCAATTCAAAAAATATCGGTGGGAAGGACAGCCC  >  minE/2204555‑2204589

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑