Missing coverage evidence...
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GTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGC  >  minE/185218‑185279                                                              | ggcGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:798094/60‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:1101369/62‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:867320/62‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:812729/62‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:793137/62‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:733834/62‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:728631/62‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:694767/62‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:662935/62‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:652528/62‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:633633/62‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:618315/62‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:600289/62‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:570851/62‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:553783/62‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:382175/62‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:377620/62‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:335194/62‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:107071/62‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:568941/62‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:1126656/62‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:148366/62‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:136870/62‑1 (MQ=255) gTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGGGATCcgc  <  1:295811/62‑1 (MQ=255)  tCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:192671/61‑1 (MQ=255)  tCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:961930/61‑1 (MQ=255)  tCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:754856/61‑1 (MQ=255)  tCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:349171/61‑1 (MQ=255)   cGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:19607/60‑1 (MQ=255)      gATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:999650/57‑1 (MQ=255)        tGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCcgc  <  1:868158/55‑1 (MQ=255)                                                              | GTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGC  >  minE/185218‑185279

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑