Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2242625	2242829	205	52 [0]	[0] 57	yjaG	conserved hypothetical protein

ACGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACA  >  minE/2242563‑2242624                                                              | aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCTGGATAAACGCCGTACa  <  1:998829/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:475630/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:487030/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:1023959/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:498664/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:509271/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:555903/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:579204/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:59036/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:642892/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:650564/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:670108/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:68907/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:733707/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:76752/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:775308/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:78174/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:801137/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:84386/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:860707/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:901375/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:917846/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:968856/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:982084/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:177172/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:1065063/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:1066053/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:1070281/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:1100735/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:1102656/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:1122966/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:1150024/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:1155894/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:1163921/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:1172542/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:158893/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:430693/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:211510/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:225821/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:243275/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:256083/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:270075/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:320795/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:354263/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:377072/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:396701/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:401300/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATAGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:1098882/62‑1 (MQ=255) aCGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCAACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:567895/62‑1 (MQ=255)  cgcgAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGGCGGATAAACGCCGTACa  <  1:777008/61‑1 (MQ=255)  cgcgAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:645621/61‑1 (MQ=255)                        aCGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACa  <  1:566013/39‑1 (MQ=255)                                                              | ACGCGAATGGACCAGTTCACTTAACGCCACGCAGGCATCGATTGCCGGATAAACGCCGTACA  >  minE/2242563‑2242624

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑