Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2250864 2250886 23 64 [0] [1] 7 thiH thiamin biosynthesis ThiGH complex subunit

ATCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGCC  >  minE/2250816‑2250863
                                               |
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:71043/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:1057829/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:479801/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:496402/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:502459/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:502657/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:551371/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:569497/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:620288/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:625011/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:631009/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:636158/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:649270/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:667489/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:667637/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:710178/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:469738/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:711202/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:712013/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:731129/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:786512/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:792867/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:803129/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:844954/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:848440/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:860208/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:884631/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:891746/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:929394/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:975590/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:975915/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:977992/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:447432/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:1096996/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:1102189/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:1106776/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:1119094/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:1126102/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:113007/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:1154830/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:1171654/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:1188883/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:1189422/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:154485/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:158230/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:167417/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:179737/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:223570/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:447724/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:393980/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:360943/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:334369/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:326413/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:314437/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:29737/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:276728/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:273047/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:228736/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:22681/48‑1 (MQ=255)
aTCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:191792/48‑1 (MQ=255)
 tCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:1167039/47‑1 (MQ=255)
 tCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:859397/47‑1 (MQ=255)
          aaaCGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:411471/38‑1 (MQ=255)
             cGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGcc  <  1:1090267/35‑1 (MQ=255)
                                               |
ATCAAGCGCAAAACGCTGGATGAAGCGGATATTGCCAGGGAAAGTGCC  >  minE/2250816‑2250863

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: