Missing coverage evidence...
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ACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGT  >  minE/2254006‑2254067                                                              | aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:769302/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:477554/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:51584/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:572376/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:640740/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:64630/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:658795/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:69856/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:706884/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:722898/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:745139/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:75698/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:1095326/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:792457/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:815092/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:837274/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:884028/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:887477/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:900293/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:911059/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:920074/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:920732/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:924349/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:448299/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:1114098/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:1126647/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:1167444/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:1191109/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:1192412/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:147981/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:165498/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:206768/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:21602/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:221656/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:296157/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:297634/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:314156/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:334780/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:351046/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:396580/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:417304/62‑1 (MQ=255) aCCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:476857/62‑1 (MQ=255)  ccTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:325376/61‑1 (MQ=255)  ccTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:38185/61‑1 (MQ=255)  ccTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:11826/61‑1 (MQ=255)  ccTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:909357/61‑1 (MQ=255)  ccTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:1094226/61‑1 (MQ=255)  ccTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGt  <  1:983591/61‑1 (MQ=255)                                                              | ACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGT  >  minE/2254006‑2254067

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑