Missing coverage evidence...
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CAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAG  >  minE/2285419‑2285466                                                | cAGGCCACAGAGCCAACTATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:1174843/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:356944/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:967155/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:93747/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:895900/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:851928/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:838500/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:706055/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:569703/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:504719/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:46878/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:465768/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:457782/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:357873/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:1036907/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:201810/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:191628/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:1841/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:17616/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:170200/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:125008/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:1122644/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:1121023/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:1110595/48‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:1084107/48‑1 (MQ=255)  aGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:322539/47‑1 (MQ=255)  aGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAg  <  1:497643/47‑1 (MQ=255)                                                | CAGGCCACAGAGCCAACAATATCCTGCTCCGCCAGACGGTAATCAAAG  >  minE/2285419‑2285466

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑