Missing coverage evidence...
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GCAAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAAT  >  minE/2407387‑2407448                                                              | gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:106208/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:905318/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:855616/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:847984/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:841299/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:769031/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:764324/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:751774/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:733785/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:693890/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:668780/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:59332/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:497935/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:372101/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:368865/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:300259/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:294169/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:1070099/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:1124007/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:1188968/62‑1 (MQ=255)  caAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:481108/61‑1 (MQ=255)  caAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:963843/61‑1 (MQ=255)  caAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:899431/61‑1 (MQ=255)  caAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:1125396/61‑1 (MQ=255)  caAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:827408/61‑1 (MQ=255)  caAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:198009/61‑1 (MQ=255)  caAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:747209/61‑1 (MQ=255)  caAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:352013/61‑1 (MQ=255)   aaGCGCGCGATCCACAGGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:428179/60‑1 (MQ=255)   aaGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:157086/60‑1 (MQ=255)                       aTTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:1052842/40‑1 (MQ=255)                        ttGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:820706/39‑1 (MQ=255)                                                              | GCAAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAAT  >  minE/2407387‑2407448

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑