Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2441137	2441336	200	57 [0]	[0] 39	ilvY	DNA‑binding transcriptional dual regulator

ATCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCCGCGC  >  minE/2441075‑2441136                                                              | atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:740857/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:475297/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:1005180/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:522042/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:569008/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:590265/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:608313/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:632707/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:668966/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:684472/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:691831/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:719699/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:740677/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:496463/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:768356/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:77203/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:799014/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:806341/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:825074/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:836818/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:847265/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:925789/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:940949/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:980317/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:993983/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:167562/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:1006232/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:1007750/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:1027143/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:1037576/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:1135907/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:1137294/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:114447/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:1193009/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:423818/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:183434/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:214559/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:245052/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:398034/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:311548/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:389173/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:337174/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:357950/62‑1 (MQ=255) atCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCACCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:1078319/62‑1 (MQ=255)  tcttctGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:187342/61‑1 (MQ=255)  tcttctGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:98722/61‑1 (MQ=255)  tcttctGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:387562/61‑1 (MQ=255)  tcttctGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:906764/61‑1 (MQ=255)  tcttctGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:841293/61‑1 (MQ=255)  tcttctGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:368824/61‑1 (MQ=255)  tcttctGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:801260/61‑1 (MQ=255)  tcttctGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:33428/61‑1 (MQ=255)  tcttctGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:157497/61‑1 (MQ=255)  tcttctGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:770501/61‑1 (MQ=255)  tcttctGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:763398/61‑1 (MQ=255)  tcttctGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:263907/61‑1 (MQ=255)   cttctGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCcgcgc  <  1:451428/60‑1 (MQ=255)                                                              | ATCTTCTGCTCGGTGACCGCTGCCTACAGCCATCTGCCGCCGATTCTGGATCGCTTCCGCGC  >  minE/2441075‑2441136

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑