Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2443365	2443497	133	24 [0]	[0] 22	ilvD	dihydroxyacid dehydratase

TTTATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCAA  >  minE/2443303‑2443364                                                              | tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:651496/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:967325/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:961632/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:960252/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:949603/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:934355/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:930461/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:920161/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:869593/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:869555/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:715637/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:671013/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:1055187/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:625303/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:587615/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:545752/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:471493/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:460075/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:426246/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:353244/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:350513/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:175962/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:1195364/62‑1 (MQ=255) tttATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCaa  <  1:1081079/62‑1 (MQ=255)                                                              | TTTATCGCGCACCGCGCCTTTGTCGGCGCTGGTTGCCAGGCTGGCATAAGCACGCAGGGCAA  >  minE/2443303‑2443364

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑