Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2444812	2445024	213	51 [0]	[0] 6	ilvD	dihydroxyacid dehydratase

ATCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGTT  >  minE/2444750‑2444811                                                              | aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCGGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:242345/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATTGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:48028/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:668252/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:415996/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:424276/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:434271/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:45397/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:484112/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:547413/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:583483/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:613593/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:63881/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:662824/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:396338/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:669515/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:669616/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:68573/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:689464/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:729537/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:765001/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:786576/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:815568/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:86874/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:882351/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:907950/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:909313/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:153889/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:1015230/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:1033315/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:1067437/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:1074507/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:1107424/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:1123769/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:1149424/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:1189434/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:137702/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:14467/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:146769/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:1012819/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:199888/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:214297/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:27798/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:281845/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:297499/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:300661/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:312662/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:32915/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:354036/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:380778/62‑1 (MQ=255) aTCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGGCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:436992/62‑1 (MQ=255)          gTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGGCCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGtt  <  1:142/53‑1 (MQ=255)                                                              | ATCCCCGGGGTGATTTTGTCGCAGTTAGAGATGCAGACCATGGCGTCGGCGCAGTGGGCGTT  >  minE/2444750‑2444811

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑