Missing coverage evidence...
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GAAGTGCTGCTGCTCGACGAACCGTGTTCGGCGCTCGACCCTATCTCTACCGGGCGTATTGA  >  minE/2478544‑2478605                                                              | ggaGTGCTGCTGCTCGACGAACCGTGTTCGGCGCTCGACCCTATCTCTACCGGGCGTATTGa  <  1:479576/60‑1 (MQ=255) gAAGTGCTGCTGCTCGACGAACCGTGTTCGGCGCTCGACCCTATCTCTACCGGGCGTATTGa  <  1:137575/62‑1 (MQ=255) gAAGTGCTGCTGCTCGACGAACCGTGTTCGGCGCTCGACCCTATCTCTACCGGGCGTATTGa  <  1:877316/62‑1 (MQ=255) gAAGTGCTGCTGCTCGACGAACCGTGTTCGGCGCTCGACCCTATCTCTACCGGGCGTATTGa  <  1:786608/62‑1 (MQ=255) gAAGTGCTGCTGCTCGACGAACCGTGTTCGGCGCTCGACCCTATCTCTACCGGGCGTATTGa  <  1:554682/62‑1 (MQ=255) gAAGTGCTGCTGCTCGACGAACCGTGTTCGGCGCTCGACCCTATCTCTACCGGGCGTATTGa  <  1:506793/62‑1 (MQ=255) gAAGTGCTGCTGCTCGACGAACCGTGTTCGGCGCTCGACCCTATCTCTACCGGGCGTATTGa  <  1:480070/62‑1 (MQ=255) gAAGTGCTGCTGCTCGACGAACCGTGTTCGGCGCTCGACCCTATCTCTACCGGGCGTATTGa  <  1:478591/62‑1 (MQ=255) gAAGTGCTGCTGCTCGACGAACCGTGTTCGGCGCTCGACCCTATCTCTACCGGGCGTATTGa  <  1:436180/62‑1 (MQ=255) gAAGTGCTGCTGCTCGACGAACCGTGTTCGGCGCTCGACCCTATCTCTACCGGGCGTATTGa  <  1:424205/62‑1 (MQ=255) gAAGTGCTGCTGCTCGACGAACCGTGTTCGGCGCTCGACCCTATCTCTACCGGGCGTATTGa  <  1:303148/62‑1 (MQ=255) gAAGTGCTGCTGCTCGACGAACCGTGTTCGGCGCTCGACCCTATCTCTACCGGGCGTATTGa  <  1:288704/62‑1 (MQ=255) gAAGTGCTGCTGCTCGACGAACCGTGTTCGGCGCTCGACCCTATCTCTACCGGGCGTATTGa  <  1:265713/62‑1 (MQ=255) gAAGTGCTGCTGCTCGACGAACCGTGTTCGGCGCTCGACCCTATCTCTACCGGGCGTATTGa  <  1:150950/62‑1 (MQ=255) gAAGTGCTGCTGCTCGACGAACCGTGTTCGGCGCTCGACCCTATCTCTACCGGGCGTATTGa  <  1:1074016/62‑1 (MQ=255) gAAGTGCTGCTGCTCGACGAACCGTGTTCGGCGCTCGACCATATCTCTACCGGGCGTATTGa  <  1:589230/62‑1 (MQ=255)  aaGTGCTGCTGCTCGACGAACCGTGTTCGGCGCTCGACCCTATCTCTACCGGGCGTATTGa  <  1:94923/61‑1 (MQ=255)               cgacgaACCGTGTTCGGCGCTCGACCCTATCTCTACCGGGCGTATTGa  <  1:493666/48‑1 (MQ=255)                                                              | GAAGTGCTGCTGCTCGACGAACCGTGTTCGGCGCTCGACCCTATCTCTACCGGGCGTATTGA  >  minE/2478544‑2478605

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑