Missing coverage evidence...
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AAGACTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTTA  >  minE/2478773‑2478834                                                              | aagtCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGAAAGTCTCAATCTta  <  1:845837/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:345290/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:965577/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:892733/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:852859/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:836648/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:776568/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:717789/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:685754/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:613549/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:544971/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:479259/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:44166/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:388884/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:1027385/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:344063/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:140544/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:104943/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:1053880/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:1145227/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:115479/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:1199532/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:329798/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:171601/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:179730/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:206283/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:261808/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:278133/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:296047/62‑1 (MQ=255) aagaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACACTCTCAATCTta  <  1:569227/62‑1 (MQ=255)  agaCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:1107741/61‑1 (MQ=255)    aCTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:73544/59‑1 (MQ=255)     cTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:590598/58‑1 (MQ=255)              cGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:1096606/49‑1 (MQ=255)                   gTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTta  <  1:918656/44‑1 (MQ=255)                                                              | AAGACTACATCACCGGTCGTTACGGTTGATTCAGGAGTGCGTTATGGACAGTCTCAATCTTA  >  minE/2478773‑2478834

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑