Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2499512	2499535	24	42 [0]	[1] 59	[uhpA]	[uhpA]

GGCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGA  >  minE/2499452‑2499511                                                            | ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:693899/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:1010850/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:516425/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:533727/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:558557/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:60/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:614041/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:634604/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:673083/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:690499/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:505634/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:701629/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:72207/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:754013/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:758455/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:813037/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:843786/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:853439/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:858150/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:953782/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:346410/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:101430/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:1021404/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:1110529/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:1111288/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:1161749/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:1165586/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:204448/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:218221/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:346347/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:500552/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:396677/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:401243/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:404119/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:421408/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:438233/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:463619/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:467861/60‑1 (MQ=255) ggCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:479762/60‑1 (MQ=255)  gCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:244295/59‑1 (MQ=255)  gCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:615413/59‑1 (MQ=255)                   cTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGa  <  1:664729/42‑1 (MQ=255)                                                            | GGCTTGAACAACATCGCGCTTATCGTTAAGGTAAGCGCGTATTTTTTTTACCCGCCAGGA  >  minE/2499452‑2499511

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑