Missing coverage evidence...
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ATGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTG  >  minE/2513724‑2513785                                                              | aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:628385/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:335390/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:344541/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:1016895/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:428625/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:499357/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:517482/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:58814/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:61788/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:397183/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:64367/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:742126/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:797316/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:800072/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:835554/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:912824/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:973907/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:1138896/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:1023922/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:1031151/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:1053490/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:1073846/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:1085171/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:1111229/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:287318/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:1149081/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:1199605/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:142432/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:144857/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:188058/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:218931/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:23227/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:256805/62‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGATACCTg  <  1:651641/62‑1 (MQ=255)  tGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:574480/61‑1 (MQ=255)  tGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:785975/61‑1 (MQ=255)  tGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:401636/61‑1 (MQ=255)  tGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:946654/61‑1 (MQ=255)      ggCGATTCTGGTGGTACAGACAATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTg  <  1:878395/57‑1 (MQ=255)                                                              | ATGCTGGCGATTCTGGTGGTACAGACCATCTTCATGGCGTTGTATGCCATCTTCGTTACCTG  >  minE/2513724‑2513785

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑