Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2516748	2516776	29	50 [0]	[0] 6	trmH	tRNA (Guanosine‑2'‑O‑)‑methyltransferase

TGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGT  >  minE/2516689‑2516747                                                           | tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:766189/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:1004041/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:51602/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:532294/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:604890/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:61051/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:620203/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:621540/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:655871/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:709953/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:748588/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:764865/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:50109/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:767774/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:823246/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:839082/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:854286/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:895438/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:896905/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:904230/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:914059/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:920815/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:935629/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:979355/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:257913/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:1102641/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:1109545/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:1111727/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:1126251/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:1159638/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:1160024/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:1081788/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:11922/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:494143/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:191150/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:274078/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:280734/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:281137/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:343808/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:35749/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:360164/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:1070512/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:375081/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:411744/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:414492/59‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCTTTGAGATCAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:138415/59‑1 (MQ=255)  gCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:795601/58‑1 (MQ=255)  gCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:552175/58‑1 (MQ=255)    ccTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:1019210/56‑1 (MQ=255)                      cGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGt  <  1:1091474/38‑1 (MQ=255)                                                           | TGCCCTGGCCTTTGAGATGAGCGACGGCATCGCCAATGGTGCGGTGTGTTTTCACCTGT  >  minE/2516689‑2516747

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑