Missing coverage evidence...
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CTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGC  >  minE/2518901‑2518953                                                     | ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:752662/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:395802/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:396470/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:405678/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:444707/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:551659/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:551883/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:63618/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:647233/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:666664/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:721819/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:1067543/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:790425/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:80182/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:852096/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:86200/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:862314/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:877207/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:928540/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:95664/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:985529/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:362407/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:1007305/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:1085998/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:1087912/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:1099223/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:1112462/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:1119363/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:1176305/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:1197758/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:128016/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:205621/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:249952/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:272463/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:298245/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:310610/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:320271/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:324702/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:333756/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:343363/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:395285/1‑53 (MQ=255) ctcGGCCAGAATGCAGGCAACAGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGc  >  1:986231/1‑53 (MQ=255)                                                     | CTCGGCCAGAATGCAGGCAACCGCTACCGGGTGCGTGATATAGGGTTCACCGC  >  minE/2518901‑2518953

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑