Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2519899 2520094 196 66 [0] [1] 19 [gmk] [gmk]

CGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGT  >  minE/2519837‑2519898
                                                             |
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:698395/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:451178/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:482646/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:1039079/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:534050/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:540097/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:559907/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:571245/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:583682/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:587161/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:589463/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:621406/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:623510/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:670211/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:688797/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:691298/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:505882/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:715655/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:716758/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:761375/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:8174/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:820182/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:843346/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:84809/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:900737/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:941052/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:949886/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:974884/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:977023/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:977548/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:984179/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:370097/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:1045614/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:106183/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:1068185/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:1093449/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:1106083/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:1118966/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:1125786/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:1149809/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:1151964/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:1153305/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:1170668/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:134213/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:181345/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:230211/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:270804/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:417480/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:354/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:334703/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:297437/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:29610/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:295986/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:290138/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:270285/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:270174/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:251987/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:233946/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCAACATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:124837/62‑1 (MQ=255)
cGCATCTCTGCTAATCATTTCTATAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:857871/62‑1 (MQ=255)
 gCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:595790/61‑1 (MQ=255)
 gCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:233535/61‑1 (MQ=255)
 gCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:750309/61‑1 (MQ=255)
 gCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:211025/61‑1 (MQ=255)
           tAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACATAGAAATAATTTTCACCGt  <  1:602923/51‑1 (MQ=255)
             aTCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGt  <  1:976264/49‑1 (MQ=255)
                                                             |
CGCATCTCTGCTAATCATTTCTTTAAATTCATCATGATTAACAAAGAAATAATGTTCACCGT  >  minE/2519837‑2519898

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: