Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2535565	2535571	7	22 [0]	[0] 9	rfaP	kinase that phosphorylates core heptose of lipopolysaccharide

GATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTG  >  minE/2535503‑2535564                                                              | gATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTg  <  1:38986/62‑1 (MQ=255) gATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTg  <  1:888670/62‑1 (MQ=255) gATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTg  <  1:766622/62‑1 (MQ=255) gATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTg  <  1:758886/62‑1 (MQ=255) gATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTg  <  1:751790/62‑1 (MQ=255) gATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTg  <  1:679334/62‑1 (MQ=255) gATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTg  <  1:61968/62‑1 (MQ=255) gATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTg  <  1:617348/62‑1 (MQ=255) gATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTg  <  1:54503/62‑1 (MQ=255) gATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTg  <  1:473186/62‑1 (MQ=255) gATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTg  <  1:1015826/62‑1 (MQ=255) gATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTg  <  1:360191/62‑1 (MQ=255) gATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTg  <  1:341146/62‑1 (MQ=255) gATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTg  <  1:309561/62‑1 (MQ=255) gATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTg  <  1:273582/62‑1 (MQ=255) gATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTg  <  1:272193/62‑1 (MQ=255) gATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTg  <  1:261343/62‑1 (MQ=255) gATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTg  <  1:14950/62‑1 (MQ=255) gATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTg  <  1:148904/62‑1 (MQ=255) gATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTg  <  1:1168708/62‑1 (MQ=255) gATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTg  <  1:1080376/62‑1 (MQ=255)  atatCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTg  <  1:830563/61‑1 (MQ=255)                                                              | GATATCATTACAGGTGGTTTAGATGGTTGAATTAAAAGAGCCGCTTGCCACACTTTGGCGTG  >  minE/2535503‑2535564

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑