Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2536720 2536746 27 36 [0] [0] 15 rfaS lipopolysaccharide core biosynthesis protein

AAGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGC  >  minE/2536666‑2536719
                                                     |
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:727311/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:1024486/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:440056/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:443198/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:451200/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:464596/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:518170/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:644052/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:683149/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:418867/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:776207/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:795184/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:905852/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:906441/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:931284/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:945449/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:995463/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:996518/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:1156180/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:1025741/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:1045911/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:1052078/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:1072621/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:1095543/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:1119026/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:113412/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:114234/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:401364/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:1174121/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:120954/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:136541/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:153559/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:243255/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:329106/54‑1 (MQ=255)
aaGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:36649/54‑1 (MQ=255)
   aTTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGc  <  1:514934/51‑1 (MQ=255)
                                                     |
AAGATTTTATTCTTGATAACGCGAATTATTTCGATATTATATATGATTTTGAGC  >  minE/2536666‑2536719

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: