Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2538394	2538722	329	7 [0]	[0] 40	[rfaB]–[rfaI]	[rfaB],[rfaI]

CTGCGTCGATCGATGAATTTTACCAATCGAAGTATTACGATAGATTACATAAGGTAATTATT  >  minE/2538332‑2538393                                                              | cTGCGTCGATCGATGAATTTTACCAATCGAAGTATTACGATAGATTACATAAGGTAattatt  >  1:1027330/1‑62 (MQ=255) cTGCGTCGATCGATGAATTTTACCAATCGAAGTATTACGATAGATTACATAAGGTAattatt  >  1:166776/1‑62 (MQ=255) cTGCGTCGATCGATGAATTTTACCAATCGAAGTATTACGATAGATTACATAAGGTAattatt  >  1:190272/1‑62 (MQ=255) cTGCGTCGATCGATGAATTTTACCAATCGAAGTATTACGATAGATTACATAAGGTAattatt  >  1:232617/1‑62 (MQ=255) cTGCGTCGATCGATGAATTTTACCAATCGAAGTATTACGATAGATTACATAAGGTAattatt  >  1:526350/1‑62 (MQ=255) cTGCGTCGATCGATGAATTTTACCAATCGAAGTATTACGATAGATTACATAAGGTAattatt  >  1:662637/1‑62 (MQ=255) cTGCGTCGATCGATGAATTTTACCAATCGAAGTATTACGATAGATTACATAAGGTAattatt  >  1:825094/1‑62 (MQ=255)                                                              | CTGCGTCGATCGATGAATTTTACCAATCGAAGTATTACGATAGATTACATAAGGTAATTATT  >  minE/2538332‑2538393

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑