Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2540497	2540498	2	42 [0]	[0] 3	rfaJ/rfaY	UDP‑D‑glucose:(galactosyl)lipopolysaccharide glucosyltransferase/lipopolysaccharide core biosynthesis protein

ATCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACATT  >  minE/2540436‑2540496                                                             | atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:766898/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:100034/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:43729/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:456065/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:487212/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:497048/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:518596/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:527454/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:573499/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:578853/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:431651/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:822548/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:832741/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:838574/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:843205/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:912168/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:937189/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:966448/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:97010/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:9765/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:420827/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:1053916/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:107222/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:112604/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:1130009/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:117653/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:1189498/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:1191194/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:169455/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:221254/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:249608/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:250171/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:295957/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:349746/61‑1 (MQ=255) atCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:423380/61‑1 (MQ=255)  tctcAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:157434/60‑1 (MQ=255)  tctcAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:1150222/60‑1 (MQ=255)  tctcAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:255141/60‑1 (MQ=255)  tctcAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:976487/60‑1 (MQ=255)  tctcAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATAATACCGTAAATAACAtt  <  1:1191131/60‑1 (MQ=255)          aTTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:223053/52‑1 (MQ=255)                     aGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACAtt  <  1:756395/41‑1 (MQ=255)                                                             | ATCTCAGGAATTATAGCAGGAGTCTGTTATCTTTGCCGAAAATATTACCGTAAATAACATT  >  minE/2540436‑2540496

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑