Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2562040	2562382	343	18 [0]	[0] 34	lldR	DNA‑binding transcriptional repressor

AACGTCCGCTTGTGAGGCGATATCCGGGTCTTCACTTAGCGTTGCTTCAAAGCAAAGCTGAA  >  minE/2561978‑2562039                                                              | aacgTCCGCTTGTGAGGCGATATCCGGGTCTTCACTTAGCGTTGCTTCAAAGCAAAGCTGaa  >  1:517829/1‑62 (MQ=255) aacgTCCGCTTGTGAGGCGATATCCGGGTCTTCACTTAGCGTTGCTTCAAAGCAAAGCTGaa  >  1:943859/1‑62 (MQ=255) aacgTCCGCTTGTGAGGCGATATCCGGGTCTTCACTTAGCGTTGCTTCAAAGCAAAGCTGaa  >  1:891327/1‑62 (MQ=255) aacgTCCGCTTGTGAGGCGATATCCGGGTCTTCACTTAGCGTTGCTTCAAAGCAAAGCTGaa  >  1:878476/1‑62 (MQ=255) aacgTCCGCTTGTGAGGCGATATCCGGGTCTTCACTTAGCGTTGCTTCAAAGCAAAGCTGaa  >  1:867371/1‑62 (MQ=255) aacgTCCGCTTGTGAGGCGATATCCGGGTCTTCACTTAGCGTTGCTTCAAAGCAAAGCTGaa  >  1:751933/1‑62 (MQ=255) aacgTCCGCTTGTGAGGCGATATCCGGGTCTTCACTTAGCGTTGCTTCAAAGCAAAGCTGaa  >  1:735927/1‑62 (MQ=255) aacgTCCGCTTGTGAGGCGATATCCGGGTCTTCACTTAGCGTTGCTTCAAAGCAAAGCTGaa  >  1:734313/1‑62 (MQ=255) aacgTCCGCTTGTGAGGCGATATCCGGGTCTTCACTTAGCGTTGCTTCAAAGCAAAGCTGaa  >  1:713852/1‑62 (MQ=255) aacgTCCGCTTGTGAGGCGATATCCGGGTCTTCACTTAGCGTTGCTTCAAAGCAAAGCTGaa  >  1:103555/1‑62 (MQ=255) aacgTCCGCTTGTGAGGCGATATCCGGGTCTTCACTTAGCGTTGCTTCAAAGCAAAGCTGaa  >  1:507697/1‑62 (MQ=255) aacgTCCGCTTGTGAGGCGATATCCGGGTCTTCACTTAGCGTTGCTTCAAAGCAAAGCTGaa  >  1:460079/1‑62 (MQ=255) aacgTCCGCTTGTGAGGCGATATCCGGGTCTTCACTTAGCGTTGCTTCAAAGCAAAGCTGaa  >  1:359624/1‑62 (MQ=255) aacgTCCGCTTGTGAGGCGATATCCGGGTCTTCACTTAGCGTTGCTTCAAAGCAAAGCTGaa  >  1:307410/1‑62 (MQ=255) aacgTCCGCTTGTGAGGCGATATCCGGGTCTTCACTTAGCGTTGCTTCAAAGCAAAGCTGaa  >  1:199566/1‑62 (MQ=255) aacgTCCGCTTGTGAGGCGATATCCGGGTCTTCACTTAGCGTTGCTTCAAAGCAAAGCTGaa  >  1:179634/1‑62 (MQ=255) aacgTCCGCTTGTGAGGCGATATCCGGGTCTTCACTTAGCGTTGCTTCAAAGCAAAGCTGaa  >  1:1095685/1‑62 (MQ=255) aacgTCCGCTTGTGAGGCGATATCCGGGTCTTCACTTAGCGTTGCTTCAAAGCAAAGCTGaa  >  1:1048/1‑62 (MQ=255)                                                              | AACGTCCGCTTGTGAGGCGATATCCGGGTCTTCACTTAGCGTTGCTTCAAAGCAAAGCTGAA  >  minE/2561978‑2562039

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑