Missing coverage evidence...
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GGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTG  >  minE/231713‑231773                                                             | ggAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTATCTCCCCCTTTCTg  <  1:593468/61‑1 (MQ=255) ggAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:456805/61‑1 (MQ=255) ggAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:876508/61‑1 (MQ=255) ggAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:775335/61‑1 (MQ=255) ggAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:75909/61‑1 (MQ=255) ggAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:725255/61‑1 (MQ=255) ggAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:702391/61‑1 (MQ=255) ggAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:61745/61‑1 (MQ=255) ggAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:617389/61‑1 (MQ=255) ggAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:554023/61‑1 (MQ=255) ggAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:1049654/61‑1 (MQ=255) ggAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:441579/61‑1 (MQ=255) ggAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:428255/61‑1 (MQ=255) ggAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:410839/61‑1 (MQ=255) ggAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:371633/61‑1 (MQ=255) ggAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:334608/61‑1 (MQ=255) ggAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:290109/61‑1 (MQ=255) ggAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:253681/61‑1 (MQ=255) ggAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:173556/61‑1 (MQ=255) ggAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:1134331/61‑1 (MQ=255) ggAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:1085541/61‑1 (MQ=255)  gagaGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:541984/60‑1 (MQ=255)    gagGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:108413/58‑1 (MQ=255)          tAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:794737/52‑1 (MQ=255)                      gCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:832734/40‑1 (MQ=255)                          tCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTg  <  1:165563/36‑1 (MQ=255)                                                             | GGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTG  >  minE/231713‑231773

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑