Missing coverage evidence...
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TCCGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGC  >  minE/2652562‑2652623                                                              | cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:809084/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:627772/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:671186/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:67153/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:687900/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:70140/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:701818/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:718084/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:762685/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:773019/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:785015/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:586938/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:811065/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:842124/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:855918/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:878471/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:885469/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:887451/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:89725/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:945301/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:981752/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:305225/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:1021988/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:1041628/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:1133675/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:148501/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:15249/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:18258/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:217961/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:223250/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:260123/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:272279/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:100955/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:366828/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:45466/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:455194/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:476604/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:490760/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:52068/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:546179/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:578007/61‑1 (MQ=255) cccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:581809/61‑1 (MQ=255)  ccGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGc  <  1:772765/61‑1 (MQ=255)                                                              | TCCGACCCGGATGCCGAGCCGTACTGGCGCGATGTGGGTACGCTGGAAGCTTACTGGAAAGC  >  minE/2652562‑2652623

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑