Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2663781	2663911	131	70 [0]	[0] 24	rtcB	conserved hypothetical protein

GGGCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGT  >  minE/2663729‑2663780                                                    | gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:62441/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:759715/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:739991/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:728877/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:715396/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:710759/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:708323/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:629811/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:627548/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:80453/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:623336/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:621873/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:576389/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:566775/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:563763/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:555826/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:534789/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:530400/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:9133/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:999266/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:992618/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:985219/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:983792/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:948252/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:936394/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:935359/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:919498/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:525818/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:909044/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:907650/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:899672/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:895432/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:886796/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:861711/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:820369/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:1149621/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:287403/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:253352/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:246990/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:244829/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:203146/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:189280/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:180057/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:161335/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:292386/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:1144570/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:1137762/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:1119355/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:110309/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:1084915/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:1070614/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:1031643/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:1006037/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:389701/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:499754/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:466744/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:458187/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:454714/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:451877/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:450556/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:398537/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:1005505/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:386531/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:382176/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:376007/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:35828/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:350463/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:338434/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:295432/1‑52 (MQ=255) gggCGCAGCCTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGt  >  1:468893/1‑52 (MQ=255)                                                    | GGGCGCAGCTTTTTGCCAGCCTTAACCGCGATGCGATGATGGAAAACGTGGT  >  minE/2663729‑2663780

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑