Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2698693	2698860	168	57 [0]	[0] 3	yrfD	predicted pilus assembly protein

GGGAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTCC  >  minE/2698631‑2698692                                                              | gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:735610/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:364982/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:371484/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:406731/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:472393/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:1016899/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:555845/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:556363/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:679625/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:690332/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:7143/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:726254/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:51261/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:764634/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:792637/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:79419/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:845685/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:870886/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:877642/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:892187/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:925685/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:980454/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:98656/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:1066727/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:1118305/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:1139967/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:19493/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:207675/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:221192/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:162007/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:221985/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:1042743/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:362758/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:254593/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:258103/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:259180/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:304236/62‑1 (MQ=255) gggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTAGATATGGATCCGGACTcc  <  1:969796/62‑1 (MQ=255)  ggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:810877/61‑1 (MQ=255)  ggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:1041105/61‑1 (MQ=255)  ggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:812249/61‑1 (MQ=255)  ggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:875109/61‑1 (MQ=255)  ggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:1100951/61‑1 (MQ=255)  ggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:1076769/61‑1 (MQ=255)  ggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:923393/61‑1 (MQ=255)  ggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:176271/61‑1 (MQ=255)  ggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:747144/61‑1 (MQ=255)  ggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:177824/61‑1 (MQ=255)  ggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:73138/61‑1 (MQ=255)  ggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:221551/61‑1 (MQ=255)  ggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:548721/61‑1 (MQ=255)  ggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:227210/61‑1 (MQ=255)  ggAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGAAGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:1167721/61‑1 (MQ=255)   gAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:608914/60‑1 (MQ=255)        aaCGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:647840/55‑1 (MQ=255)                         ggACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:553803/38‑1 (MQ=255)                           aCGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTcc  <  1:215645/36‑1 (MQ=255)                                                              | GGGAGCAAACGGCCTGGCTGTCAGGGACGATGGCCCGCGAGCTGGATATGGATCCGGACTCC  >  minE/2698631‑2698692

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑