Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2728168	2728251	84	42 [0]	[0] 2	kefB	potassium:proton antiporter

GCGGCGGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAT  >  minE/2728106‑2728167                                                              | tcggcggTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:70316/61‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:78965/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:522455/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:530583/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:550290/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:596567/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:601399/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:665404/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:684937/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:686733/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:701421/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:490882/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:795364/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:802159/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:808849/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:816566/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:824763/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:923257/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:954666/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:963184/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:99043/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:163128/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:1044753/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:1111289/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:1121087/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:1135122/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:1154674/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:1169338/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:1175424/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:1177929/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:149848/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:1036809/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:179356/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:236226/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:255357/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:263232/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:277107/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:32251/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:387988/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGGCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:111593/62‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGGCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:485955/62‑1 (MQ=255) gaggcggTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAt  <  1:442408/60‑1 (MQ=255)                                                              | GCGGCGGTGGTCGGTGGCATTGGCCTTGCGATGTCTTCAACTGCAATGGCGTTGCAATTGAT  >  minE/2728106‑2728167

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑