Missing coverage evidence...
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AGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCGGCT  >  minE/243384‑243445                                                              | aGTTGGGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:1174711/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGgctgct  <  1:199145/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:729829/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:403211/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:453515/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:462242/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:52085/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:598274/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:635012/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:660097/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:671749/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:675705/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:416876/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:749777/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:806665/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:808134/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:84489/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:874593/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:909989/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:939441/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:958382/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:963449/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:396874/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:1026530/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:1026889/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:1045970/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:1096644/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:111313/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:111597/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:125467/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:135853/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:184962/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:200151/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:21347/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:226476/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:401613/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:269960/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:281460/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:343966/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCgcct  <  1:1157718/62‑1 (MQ=255) aGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACACCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:519879/62‑1 (MQ=255)  gTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:1026476/61‑1 (MQ=255)  gTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:416151/61‑1 (MQ=255)  gTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:1026158/61‑1 (MQ=255)  gTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:878584/61‑1 (MQ=255)  gTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:1052949/61‑1 (MQ=255)  gTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:758924/61‑1 (MQ=255)  gTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:658735/61‑1 (MQ=255)  gTTGAGGGTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:459632/61‑1 (MQ=255)              cTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:573295/49‑1 (MQ=255)                ttttCTTCTTCGGCTAACGCCTGGTGCAAGGCCTGCTGACGGCggct  <  1:592198/47‑1 (MQ=255)                                                              | AGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCGGCT  >  minE/243384‑243445

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑