Missing coverage evidence...
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CTCTGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAG  >  minE/2751108‑2751169                                                              | ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCTGTGACCGAg  <  1:182478/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:730221/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:504611/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:549458/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:555982/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:56106/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:579993/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:625590/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:670529/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:695273/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:722428/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:466691/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:737283/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:779930/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:807569/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:809298/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:839827/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:854694/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:878580/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:971171/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:253166/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:1018439/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:1101380/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:1129681/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:1155701/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:117697/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:1183866/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:128891/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:233579/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:101519/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:25498/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:258430/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:276943/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:283878/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:318526/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:327958/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:423604/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:438399/62‑1 (MQ=255) ctctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:462863/62‑1 (MQ=255)  tctGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:793660/61‑1 (MQ=255)                          tCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAg  <  1:877170/37‑1 (MQ=255)                                                              | CTCTGGGTAACGCACTGCGCCGTATTCTGCTCTCATCGATGCCGGGTTGCGCGGTGACCGAG  >  minE/2751108‑2751169

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑