Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2758484	2758506	23	49 [0]	[0] 60	smf	conserved hypothetical protein

AATCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAATTT  >  minE/2758422‑2758483                                                              | aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATTGTCGATACAGAAAttt  <  1:476743/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:470868/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:1015687/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:30924/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:312536/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:318256/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:321143/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:366408/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:380883/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:405441/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:428325/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:439175/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:464558/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:298911/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:572960/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:613159/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:632607/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:736075/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:82142/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:826721/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:856576/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:873043/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:897322/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:990173/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:1131456/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:1042047/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:1062863/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:1064701/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:1074138/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:1074848/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:1088604/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:1091614/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:1115166/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:1124669/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:285892/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:1138315/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:1150567/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:1167744/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:1172998/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:132426/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:136997/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:190406/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:208348/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:209434/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:249712/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:26998/62‑1 (MQ=255)  aTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:533841/61‑1 (MQ=255)  aTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:795021/61‑1 (MQ=255)  aTCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAAttt  <  1:1062859/61‑1 (MQ=255)                                                              | AATCGCAAAGATTGCTAAGGCTGCTTATGGCAGGGAGATAAGGATGGTCGATACAGAAATTT  >  minE/2758422‑2758483

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑