Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2759735	2759817	83	54 [0]	[0] 11	smg	conserved hypothetical protein

AAGATATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCA  >  minE/2759673‑2759734                                                              | aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:785023/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:426225/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:467245/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:533921/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:547038/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:553653/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:575751/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:61786/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:645454/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:645729/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:709935/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:730873/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:7559/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:429265/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:835657/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:854287/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:85485/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:858446/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:868493/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:873327/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:933588/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:941312/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:942880/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:982820/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:982855/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:19074/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:1006697/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:1021039/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:1022493/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:1029806/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:1072559/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:1110157/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:1137901/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:1168013/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:1172540/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:188088/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:418334/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:221500/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:229614/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:237208/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:26472/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:325125/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:339004/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:347882/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:358665/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:375177/62‑1 (MQ=255) aagaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:406230/62‑1 (MQ=255)  agaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:769181/61‑1 (MQ=255)  agaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:1108806/61‑1 (MQ=255)  agaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:1061614/61‑1 (MQ=255)  agaTATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:1005916/61‑1 (MQ=255)               gCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:152021/48‑1 (MQ=255)                   tGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:533053/44‑1 (MQ=255)                         ggCTGGAATAAGTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCa  <  1:581343/38‑1 (MQ=37)                                                              | AAGATATCTACAATGCCCTGCTATGGCTGGAAAAACTTGCTGATTATCAGGAAGGGTTGGCA  >  minE/2759673‑2759734

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑