Missing coverage evidence...
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GATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTG  >  minE/2776063‑2776124                                                              | gATATCGCTGTGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:1067382/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATGAAAATCCTTTg  <  1:907976/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:460312/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:853932/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:781415/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:777006/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:753715/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:715617/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:710051/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:698124/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:679658/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:644330/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:634956/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:1034377/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:399970/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:32398/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:1037681/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:1052069/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:108603/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:1111136/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:1121643/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:115697/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:1180356/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:258517/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:311398/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:325958/62‑1 (MQ=255) gATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGACAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:755580/62‑1 (MQ=255) gATATAGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:1158110/62‑1 (MQ=255)  atatCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:1202088/61‑1 (MQ=255)   tatCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:596985/60‑1 (MQ=255)        cTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:900984/55‑1 (MQ=255)                   ttGCATCGCCAGATATAGTCCAGGGCAACCATAAAAATCCTTTg  <  1:515106/44‑1 (MQ=255)                                                              | GATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTG  >  minE/2776063‑2776124

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑