Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2778067	2778211	145	49 [0]	[0] 66	iclR	DNA‑binding transcriptional repressor

GCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACT  >  minE/2778005‑2778066                                                              | gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:714541/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:501394/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:504790/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:508658/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:537724/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:549039/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:562290/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:580819/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:642394/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:658325/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:688762/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:691627/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:701495/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:488401/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:717740/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:744931/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:783558/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:791598/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:808140/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:878065/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:910470/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:914465/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:972975/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:97340/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:991289/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:289147/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:1059023/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:1106302/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:1122634/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:1177698/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:159793/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:189987/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:238007/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:245280/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:272687/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:1036963/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:297131/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:302743/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:313092/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:353261/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:363559/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:36412/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:395178/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:428213/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:446125/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:449798/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTAGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:440049/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTACTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:1191229/1‑62 (MQ=255) gcgcATTCCACCGTACGCCAGCGGCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACt  >  1:1182225/1‑62 (MQ=255)                                                              | GCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAAACT  >  minE/2778005‑2778066

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑