Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2788516	2788528	13	43 [0]	[0] 9	lysC/pgi	aspartokinase III/glucosephosphate isomerase

ATTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGCT  >  minE/2788455‑2788515                                                             | aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:716755/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:463015/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:525925/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:540339/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:589288/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:593431/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:601983/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:608762/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:615853/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:693505/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:694078/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:446014/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:741673/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:821936/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:834919/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:85680/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:862433/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:910922/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:975027/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:97878/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:992882/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:9993/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:15611/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:1061592/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:1092590/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:1095948/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:1107611/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:1133959/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:1139185/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:1158878/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:1190724/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:119664/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:128970/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:1041964/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:169930/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:238691/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:257768/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:31242/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:317541/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:346337/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:360664/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:376354/1‑61 (MQ=255) aTTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGct  >  1:396942/1‑61 (MQ=255)                                                             | ATTTTCAGCCTTGGCACAAGGGAAGAGCGGAAGACGGGTGGGCGCAGAGCGATACTTCGCT  >  minE/2788455‑2788515

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑